一、myBaitsExpert–Plant–Angiosperms-353產品概述 myBaits® Angiosperms353是從600種被子植物中,篩選353個單拷貝核基因,作為捕獲序列,利用k-medoid聚類法設計靶向捕獲探針,生物素化的RNA探針長度120bp,對被子植物的353個單拷貝核基因進行定向捕獲測序。平均每個物種覆蓋283個基因,所有被子植物至少覆蓋100個直系同源單拷貝核基因。每個物種至少靶向137kbp,最大捕獲區域為250kbp,另外覆蓋了212kbp的非編碼區。
二、myBaitsExpert–Plant–Angiosperms-353產品特點
1.低投入-節約時間成本和經費成本;
2.覆蓋廣-捕獲覆蓋整個目標序列;
3.低起始量-1ng-3μg,推薦100-500ng;
4.兼容性-兼容NGS文庫制備,允許多個堿基錯配;
5.高精度-近緣和遠緣的個體或者種群精準捕獲,不引入biases;
6.高通量-多個文庫同一反應進行,每個反應pooling2-16個樣本;
7.通用性-適用于被子植物的系統進化分析,建立DNA條形碼;
三、產品應用
1.系統發生學
2.進化關系的分析
3.內含子測序
4.發現可變區域
5.DNABarcoding
6.對目標序列的富集程度進行評價
四、解決方案
我們提供的不僅僅是Angiosperms353產品,而是基于靶向捕獲測序技術的基因組學整體解決方案!
完整流程:DNA提取→純度和濃度檢測→DNA片段化→測序文庫制備→文庫質檢→雜交捕獲→捕獲序列富集→PCR產物純化→PCR產物質檢→測序→生物信息學分析。