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      雜交捕獲的優缺點和目的是怎樣的?

      發布時間:2021-12-04      點擊次數:549
        雜交捕獲的目的是什么?
        在文庫構建完成后,若是做全基因組測序,可直接將構建好的文庫按照一定的濃度、測序深度、數據量進行上機測序即可。但在實際的操作中,由于人的基因組中存在大量豐富的重復DNA序列,且考慮到測序成本的問題,所以通常會進行靶向測序,即選擇我們需要的區域進行測序,比如全外顯子測序,或者針對腫瘤患者設計的特定的Panel測序等。獲得所需的目標區域或者靶序列就需要探針與靶序列進行雜交,然后再通過捕獲雜交片段的方法進行目標區域的富集。

        雜交捕獲的優缺點:
        優點是捕獲區段大,可以達到幾百MB,超過PCR方案和MIP方案,同時根據探針的原理其均一性很好(均一性是評價捕獲技術很關鍵的參數,均-性好后續測序成本就會下降)。
        缺點是因為雜交前樣本會被隨機打斷(一般認為500bp是比較合適的長度),探針捕獲時可能和目的片段部分雜交,導致一些含有部分目標區段的片段被捕獲。所以雜交捕獲的特異性較差,容易捕獲非目標區段。

        雜交捕獲測序非常靈敏,適用于檢測單核苷酸變異、易位、結構變異、插入和缺失以及拷貝數變異。本公司提供基于雜交捕獲的全套靶向序列捕獲NGS產品,包括文庫制備和靶向序列捕獲試劑盒、外顯子組、目錄及定制探針、軟件解決方案、樣品質量控制和自動化平臺。無論研究需要目錄NGS基因組合還是包含目標基因的定制設計,都能為您提供相應解決方案。還提供了其他基于擴增子的靶向序列捕獲技術選項,用于尋找特定的目標區域。
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