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      產品速推:SWIFT 2S TURBO v2 DNA建庫試劑盒

      發布時間:2021-07-29      點擊次數:317
        優化的接頭和試劑預混液,更高的產量,更低PCR dup率。
       
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      產品特點:
       
        • 更低的起始量,更高分子復雜度文庫產出
       
        1ng起始量,3倍以上dup率的降低
       
        • 改進雜交捕獲流程所需的文庫產量
       
        優化的PCR反應試劑預混液,更少的循環數設置
       
        • 1536種接頭混合數量選擇
       
        搭配可適配Normalase流程UDI預制板,允許多至1536種樣本混合的自動化流程
       
        • 適用多種類型基因組
       
        同時兼不同復雜度的多種基因組類型。
       
        • 單一流程、多種應用
       
        用于研究全基因組,全外顯子組或大基因的通用建庫方案。
       
        Swift 2S Turbo V2 DNA建庫試劑盒為Swift 2S Turbo DNA建庫試劑盒升級版,可提供多種應用的解決方案,極大的簡化了雙鏈DNA 在Illumina?平臺測序的NGS樣品制備流程。 該技術提供快速及可高度重復的片段化文庫構建方案,兼容自動化建庫流程。
       
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      低起始量及PCR-free建庫流程
       
        優化的試劑預混液,以產生可適配于雜交捕獲流程所需的文庫產量,避免由于增加PCR循環數而產生的dup率。升級的試劑預混液也可用于雜交捕獲流程中帶磁珠的PCR擴增。
       
        支持100 ng 以上DNA起始量,通過連接反應加入長接頭的PCR-free實驗流程。小于100ng,甚至低至100pg DNA起始量,都可通過擴增或連接反應加入樣本標簽。
       
        如下圖所示,Swift 2S Turbo v2 DNA建庫試劑盒有兩種工作流程??蛇x擇您自己的全長測序接頭搭配Swift 2S Turbo Flexible v2 (產品貨號:47024或47096) 建庫試劑盒(右側流程),進行PCR-free文庫構建流程。Swift 2S Turbo v2 (產品貨號:46024或46096) 可搭配Swift非全長Y型接頭(左側流程)。
       
      支持應用:
       
      更高的文庫產量,適用于雜交捕獲流程
       
        特別優化的的PCR混合液可支持0.1–1000 ng DNA起始量及廣泛的插入片段大小。實驗使用Swift 2S Turbo v2 DNA建庫試劑盒構建文庫,將來自三種細菌菌株和人類細胞系Coriell NA12878的模擬群體的基因組DNA轉化為插入大小為350bp或200bp的NGS文庫。實驗證明,升級版本vs的試劑盒其文庫產量比Swift 2S Turbo試劑盒(v1版本)提高2至6倍(圖A)。與v1版本相比,Swift 2S Turbo v2建庫試劑盒搭配IDT xGenTM Pan-Cancer Panel 有著更高的覆蓋率和靶向富集度(圖B)
       
      圖A
       
      圖B
       
        由于Turbo v2 DNA建庫試劑盒使用優化了的接頭和試劑預混液,得到更高文庫產量和更低的PCR dup率。(A)Swift 2S Turbo v2建庫試劑盒在沒有增加PCR循環數條件下,其文庫產量比2S Turbo v1產量平均高4倍。(B) 2S Turbo v2平均覆蓋度和目標區域(堿基)中靶率比例仍然很高。實驗使用Illumina Miseq進行2 x 101 bp讀長測序,每個樣本的測序數據都均一至606k reads進行比較。
       
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      低起始量,穩定的基因組覆蓋度
       
        比較Swift 2S Turbo v2 DNA建庫試劑盒與另一主流品牌、適配于酶切打斷、使用標準HiFi DNA多聚酶的建庫試劑盒。使用上述兩種試劑盒搭配IDT xGenTM Pan-Cancer Panel用于評估雜交捕獲表現(見下表)。與另一試劑盒相比,Swift 2S Turbo v2 DNA建庫試劑盒以更少的PCR循環數產生同等的文庫產量。特別地,Swift 2S Turbo v2 DNA建庫試劑盒在低起始量樣本中,有著更均一的插入片段大小、更高的目標覆蓋度及更低的PCR率。
       
        使用1ng來自模擬細菌群落(ATCC? MSA-1000型?)的基因組材料,比較Swift 2S Turbo v2 與另一品牌的酶切打斷建庫試劑盒。實驗證明,Swift 2S Turbo v2建庫試劑盒通過更少的PCR循環數得到更高的文庫產量、更低的dup率(見下表),并且在不同GC比例組成區域也有著更均一的覆蓋度(見下圖)。
       
                                          圖A                                                圖B
       
        Swift 2S Turbo v2 DNA建庫試劑盒與基于酶切的競爭品牌相比,得到更高的平均覆蓋度。使用1ng來自模擬細菌群落(ATCC? MSA-1000型?)的基因組材料,比較Swift 2S Turbo v2 DNA建庫試劑盒(圖A)與競爭品牌K(圖B)。兩款試劑盒均在PCR擴增純化步驟使用0.65x 磁珠比例,實驗使用Illumina Miseq進行2 x 101 bp讀長測序,每個樣本的測序數據都均一至5M reads。
       
        模擬微生物菌落本包含以下10種種群:B. cereus (GC% = 35.5), B. adolescentis (GC% = 59.4), C. beijerinckii (GC% = 29.9), D. radiodurans (GC% = 66.7), E. faecalis (GC% = 37.8), E. coli (GC% = 50.8), L. gasseri (GC% = 35.3), R. sphaeroides (GC% = 68.9), S. epidermidis (GC% = 32.0), S. mutans (GC% = 36.8)。
       
      產品信息:

      產品訂購信息 
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