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      產品速推:SWIFT AMPLICON 16S+ITS PANEL

      發布時間:2021-05-14      點擊次數:299

      SWIFT AMPLICON 16S+ITS PANEL - 基于單管反應微生物高通量綜合分析方法

       產品特點:

      • 解析復雜的宏基因組樣品

        單管多重引物混合物,可以覆蓋16S rRNA的所有可變區和真菌的ITS1、 ITS2基因區域。 

      • 解決了測序復雜度問題

        獨特的擴增子化學試劑產出多樣性的簇,不需要PhiX或者定相引物,有效reads數量至少增      加了20%。

      • 節約成本

        適應多種Illumina®測序機型和測序讀長,增大了選擇的靈活性,可訂購 384種index試劑盒         pooling更多樣品。

      • 快速的實驗流程、高質量的數據

        從DNA樣品到Illumina®測序文庫的生成少于2小時,大大縮短了時間, 提高了效率。 

       

      Swift Amplicon 16S + ITS Panel是基于16S rRNA可變區(V1-V9)和 ITS基因設計的單管多重引物體系,有利于對復雜的微生物群落(例如細菌, 古菌,真菌)的NGS分析。 

      應用領域及樣品類型:

        ● 宏基因組學: 細菌、古細菌、真菌;
               ● 環境學: 空氣、水、廢水等;
               ● 農業: 植物微生物, 土壤真菌(ITS)等;
               ● 微生物組學: 人體微生態,如皮膚、胃腸道、糞便等; 植物微生態,如表皮、根、土壤等;
               ● 法醫: 根據微生物群落鑒定死亡時間等;
               ● 鑒定和檢測復雜樣品中細菌和真菌的結構。

      完全覆蓋細菌,古菌和真菌的鑒定可變區:

       Figure1.不同于傳統的基于可變區域V3-V4或基于需要定相反向引物的特定區域的單重引物 16SrRNA的分析方法,SwiftAmplicon16S+ITSpanel對16S的全部可變區域和真菌的  ITS1/ITS2基因進行文庫構建,能夠提高文庫的復雜度、檢測靈敏度和序列的質量。

      與基于V3-V4的檢測方法相比SwiftAmplicon16S+ITSPanel更好地反映微生物群落多樣性

      Figure 2. 分別用 Swift Amplicon 16S+ITS Panel和 基于V3-V4 16S rRNA檢測方法檢測20種微生物(ATCC MSA-1003)的DNA混合物,并在Illumina® MiSeq® V3 (2×300bp reads)上測序;表明Swift Amplicon 16S+ITS Panel檢測的靈敏度和準確度均高于基于 V3-V4的檢測方法;紅色虛線方框標識的菌種是 V3-V4 檢測方法未檢測到的菌種。 

      結果一致性檢測:不同的DNA起始量、樣品類型和讀長

      Figure 3. 測試不同的樣品DNA起始量10 pg到50 ng范圍,利用Swift Amplicon 16S+ITS panel分別對MSA-1003 (下)和豬排泄物(左上)進行檢測,不同樣品起始量的檢測結果在精確度 和物種相對豐度表現一致。

      Figure 4. 利用Swift Amplicon 16S+ITS panel檢測豬的排泄物中微生物 的種類,測試了PE150和PE300兩種測序讀長,檢測到的物種數量相近。 

      試劑盒訂購信息 (部分)

       

       

       

       

       

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